Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Hoxd10P28359 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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