Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm22054-201ENSMUST00000083395 155 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Olfr1239-201ENSMUST00000099780 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Hmcn2-201ENSMUST00000113532 15646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Pik3cg-205ENSMUST00000217915 3340 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Pcdhga1-202ENSMUST00000194888 3247 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Oog4-201ENSMUST00000061277 1981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Med13l-202ENSMUST00000201010 7781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 AC131743.4-201ENSMUST00000221638 1553 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Ighv1-72-201ENSMUST00000103541 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm12385-201ENSMUST00000117439 795 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm13863-201ENSMUST00000118782 602 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Bdh2-202ENSMUST00000120397 1172 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm40-201ENSMUST00000122131 660 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm20492-201ENSMUST00000172591 286 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm28588-201ENSMUST00000191581 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm37643-201ENSMUST00000195369 1260 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Fkbp3-202ENSMUST00000220730 579 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 AC112157.1-201ENSMUST00000226016 543 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 1700009N14Rik-201ENSMUST00000029955 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm6505-201ENSMUST00000094335 648 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Stx8-203ENSMUST00000108675 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Slc25a14-202ENSMUST00000114936 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Gm43942-201ENSMUST00000204522 2859 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChgaP26339 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Spen-201ENSMUST00000078886 12082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Gm23368-201ENSMUST00000116939 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Gm9434-201ENSMUST00000118975 813 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Gm14528-201ENSMUST00000120615 231 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ChgaP26339 Gm9670-201ENSMUST00000121201 540 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms