Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TP20293 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TP20293 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TP20293 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TP20293 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TP20293 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TP20293 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TP20293 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TP20293 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TP20293 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TP20293 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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