Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Fbxl2-201ENSMUST00000035090 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Cfl2-201ENSMUST00000078124 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm28352-201ENSMUST00000186654 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm28972-201ENSMUST00000186990 2167 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm29302-201ENSMUST00000187209 2167 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm28866-201ENSMUST00000187298 2167 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm28878-201ENSMUST00000188272 2167 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm28246-201ENSMUST00000188308 2167 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm28823-201ENSMUST00000188540 2167 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm28229-201ENSMUST00000188747 2153 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm28346-201ENSMUST00000189021 2167 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Foxn1-201ENSMUST00000108294 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Prpf38a-201ENSMUST00000079213 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Asb14-203ENSMUST00000165929 1817 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Pax9-201ENSMUST00000001538 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Icosl-201ENSMUST00000105393 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Pign-210ENSMUST00000190811 3015 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm24985-201ENSMUST00000104455 129 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Stmn1-202ENSMUST00000105867 802 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 D630023F18Rik-202ENSMUST00000148020 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm14532-201ENSMUST00000156115 279 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm22762-201ENSMUST00000157395 137 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Mir3093-201ENSMUST00000175247 87 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm19705-201ENSMUST00000180495 496 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm4823-201ENSMUST00000181990 984 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm35067-201ENSMUST00000194355 647 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm43833-201ENSMUST00000198828 293 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm4873-201ENSMUST00000199402 1203 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm42654-201ENSMUST00000200789 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Calb2-202ENSMUST00000212297 1080 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm18500-201ENSMUST00000223493 820 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 AC124397.1-201ENSMUST00000224296 653 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 CT010475.1-201ENSMUST00000224753 526 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm28038F7BCN9 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms