Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Fam166b-202ENSMUST00000107928 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Rpsa-ps3-201ENSMUST00000117789 876 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Olfr330-201ENSMUST00000134055 1134 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm23021-201ENSMUST00000158765 169 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 5830468F06Rik-201ENSMUST00000184288 1104 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Klk1b11-201ENSMUST00000007156 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Cxcl5-201ENSMUST00000031318 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Tpbpa-201ENSMUST00000021885 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
H2al1jA2BFR3 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms