Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms