Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms