Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Grip1-213ENSMUST00000147454 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Thbs1-201ENSMUST00000039559 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Umodl1-201ENSMUST00000066554 5007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 B3galt5-202ENSMUST00000113800 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Sap130-201ENSMUST00000025109 4015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Nln-201ENSMUST00000109315 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Zswim9-202ENSMUST00000119139 3986 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms