Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpa3Q9CQ71 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms