Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gimap4-201ENSMUST00000067506 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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NipblQ6KCD5 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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NipblQ6KCD5 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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NipblQ6KCD5 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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NipblQ6KCD5 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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NipblQ6KCD5 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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NipblQ6KCD5 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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