Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm13944-202ENSMUST00000146495 542 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm14573-201ENSMUST00000150544 451 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm25301-201ENSMUST00000175285 113 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm23403-201ENSMUST00000179169 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Zfp493-203ENSMUST00000181319 730 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm12728-202ENSMUST00000184254 234 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm12728-203ENSMUST00000185012 234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm8976-201ENSMUST00000187136 703 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Tmem265-202ENSMUST00000190278 587 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm5150-202ENSMUST00000194367 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm42429-201ENSMUST00000198579 558 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm45213-201ENSMUST00000206065 304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Ceacam10-203ENSMUST00000206847 662 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Rps11-204ENSMUST00000211725 493 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm18362-201ENSMUST00000221786 529 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Rpl36-ps3-201ENSMUST00000085720 315 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Defb23-201ENSMUST00000099206 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Vsnl1-201ENSMUST00000072299 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Map4k4-217ENSMUST00000195636 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Zfp57-212ENSMUST00000174672 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Ston1-205ENSMUST00000150023 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm9430-201ENSMUST00000121232 1527 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Epas1-201ENSMUST00000024954 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Pex5l-205ENSMUST00000108225 3109 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Mterf2-201ENSMUST00000050813 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 B230303A05Rik-201ENSMUST00000220672 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Zfyve16-201ENSMUST00000022217 6150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Pax4-201ENSMUST00000031718 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm15169-202ENSMUST00000130794 2335 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Adamtsl3-203ENSMUST00000173287 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm8138-201ENSMUST00000169473 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm8165-201ENSMUST00000095981 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Ankfn1-202ENSMUST00000128717 2391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm31182-201ENSMUST00000219061 2391 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm9165-201ENSMUST00000208467 2044 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 A930002I21Rik-201ENSMUST00000060946 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Apod-202ENSMUST00000115230 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Uqcc2-202ENSMUST00000118613 426 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm8832-201ENSMUST00000119890 395 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm8398-201ENSMUST00000172081 364 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm17069-201ENSMUST00000172256 490 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 2410137M14Rik-202ENSMUST00000173707 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm5977-201ENSMUST00000174304 573 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Mir5135-201ENSMUST00000174997 79 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm8488-201ENSMUST00000176112 1280 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm27283-201ENSMUST00000184853 323 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Cysrt1-203ENSMUST00000186719 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mkrn3Q60764 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.6 ms