Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TceancQ3US16 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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