Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Smarca1-201ENSMUST00000077569 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef40Q3UPH7 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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