Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ctdnep1Q3TP92 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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