Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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NcstnP57716 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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NcstnP57716 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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NcstnP57716 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcstnP57716 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
NcstnP57716 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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NcstnP57716 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
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NcstnP57716 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcstnP57716 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcstnP57716 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcstnP57716 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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NcstnP57716 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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NcstnP57716 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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NcstnP57716 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcstnP57716 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcstnP57716 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcstnP57716 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NcstnP57716 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NcstnP57716 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcstnP57716 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcstnP57716 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcstnP57716 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcstnP57716 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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