Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm15709-201ENSMUST00000118354 213 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Vmn1r16-202ENSMUST00000227283 5813 ntAPPRIS P2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Nek10-206ENSMUST00000224491 9567 ntAPPRIS P2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 AC122346.2-201ENSMUST00000224326 2931 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gcnt2-201ENSMUST00000067778 4038 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Sptan1-202ENSMUST00000095083 7883 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NcanP55066 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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