Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Chd1P40201 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm16536-201ENSMUST00000162209 1589 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Chd1P40201 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chd1P40201 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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