Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gem-201ENSMUST00000029868 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm38130-201ENSMUST00000194311 1761 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Brdt-202ENSMUST00000112677 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Stx8-203ENSMUST00000108675 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm28670-201ENSMUST00000185365 1498 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm29537-202ENSMUST00000186153 1498 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm29497-201ENSMUST00000186801 1498 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm28568-201ENSMUST00000187762 1498 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm28458-202ENSMUST00000190542 1497 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm28457-202ENSMUST00000191277 1498 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm37654-201ENSMUST00000193019 1498 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm45237-202ENSMUST00000211157 2452 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm36799-201ENSMUST00000214113 1737 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm17235-201ENSMUST00000169128 964 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm37185-201ENSMUST00000193852 410 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC207128.2-202ENSMUST00000224010 808 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC165281.1-201ENSMUST00000225713 1011 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Ndufa7-201ENSMUST00000048249 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr943-205ENSMUST00000215770 8308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 2310069B03Rik-202ENSMUST00000186147 1833 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gc-201ENSMUST00000049209 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms