Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
TtrP07309 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
TtrP07309 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
TtrP07309 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
TtrP07309 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
TtrP07309 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 3110009E18Rik-202ENSMUST00000056038 401 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TtrP07309 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Stx8-202ENSMUST00000021286 1638 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm13160-201ENSMUST00000118441 627 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Mir6415-201ENSMUST00000184064 100 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TtrP07309 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms