Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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