Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

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Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm16103-201ENSMUST00000163003 1279 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm39121-201ENSMUST00000208847 525 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Serpina3f-201ENSMUST00000101080 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm26703-202ENSMUST00000181506 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm10600-201ENSMUST00000117202 2047 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Fgr-201ENSMUST00000030693 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm26802-201ENSMUST00000181066 2144 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Ap3b1-201ENSMUST00000022196 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm33533-201ENSMUST00000193853 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Flrt3-201ENSMUST00000056760 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Gm12517-201ENSMUST00000122082 425 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Fcgr4-201ENSMUST00000078825 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Smok2b-202ENSMUST00000162940 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Anpep-202ENSMUST00000107392 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r16-202ENSMUST00000227283 5813 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Dlk1-206ENSMUST00000109846 4106 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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