Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Col5a3Q9JLI2 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Col5a3Q9JLI2 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Col5a3Q9JLI2 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Col5a3Q9JLI2 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms