Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 4930455G09Rik-201ENSMUST00000126231 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm13415-202ENSMUST00000135829 565 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Tle6-213ENSMUST00000151858 627 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm24039-201ENSMUST00000157878 132 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 A530032D15Rik-203ENSMUST00000161724 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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