Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms