Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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