Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CipcQ8R0W1 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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