Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ephb1Q8CBF3 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ephb1Q8CBF3 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms