Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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