Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Trim17Q7TPM3 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Trim17Q7TPM3 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Trim17Q7TPM3 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
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