Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Ercc6-201ENSMUST00000066807 8423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Atr-201ENSMUST00000034980 8056 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms