Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
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Klhdc9Q3USL1 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
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Klhdc9Q3USL1 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Klhdc9Q3USL1 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Klhdc9Q3USL1 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Klhdc9Q3USL1 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Klhdc9Q3USL1 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Klhdc9Q3USL1 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Klhdc9Q3USL1 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Klhdc9Q3USL1 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Klhdc9Q3USL1 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Klhdc9Q3USL1 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Klhdc9Q3USL1 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Klhdc9Q3USL1 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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