Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Btn2a2-202ENSMUST00000110432 2089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Cel-201ENSMUST00000028161 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap26-216ENSMUST00000155576 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Btnl5-ps-201ENSMUST00000097346 1751 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Acot11-201ENSMUST00000065253 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnd1-201ENSMUST00000093962 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Tfam-202ENSMUST00000105432 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14799-201ENSMUST00000117502 429 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12980-201ENSMUST00000118912 336 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm45349-201ENSMUST00000210285 1074 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Cipc-205ENSMUST00000187814 4098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Cipc-201ENSMUST00000038369 4098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Fam35a-201ENSMUST00000111917 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Fabp12-201ENSMUST00000029043 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Rfx2-201ENSMUST00000002444 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 Trim34a-203ENSMUST00000106849 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb13-204ENSMUST00000207405 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Ddhd2-201ENSMUST00000033975 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 Dpy19l2-201ENSMUST00000133010 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Prc1-201ENSMUST00000047558 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Uros-201ENSMUST00000033276 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45193-201ENSMUST00000204686 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Nmnat1-202ENSMUST00000105693 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Smim7-203ENSMUST00000167290 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gtpbp6Q3U6U5 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gtpbp6Q3U6U5 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8394-201ENSMUST00000079684 952 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms