Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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