Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
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Traf3ip1Q149C2 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
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Traf3ip1Q149C2 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Traf3ip1Q149C2 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms