Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Sh3bp1P55194 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Sh3bp1P55194 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Sh3bp1P55194 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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