Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm6558-202ENSMUST00000192046 180 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Nedd4l-204ENSMUST00000224347 3150 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcanP55066 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
NcanP55066 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
NcanP55066 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
NcanP55066 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
NcanP55066 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
NcanP55066 Atg4a-ps-201ENSMUST00000117271 2115 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Olfr1395-202ENSMUST00000203377 2883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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