Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms