Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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