Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Peg13-201ENSMUST00000202826 4725 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Prdm10-201ENSMUST00000074510 3408 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Lamb3-201ENSMUST00000016315 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Pde7b-201ENSMUST00000020165 4137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 2600014E21Rik-201ENSMUST00000186411 4805 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm26903-201ENSMUST00000180749 4583 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms