Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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