Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Ank2-201ENSMUST00000044443 5775 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Polr3f-201ENSMUST00000028914 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Zswim9-202ENSMUST00000119139 3986 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprmP28828 E230020D15Rik-201ENSMUST00000208097 5899 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
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