Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm21941-201ENSMUST00000221121 562 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Aldoart1-202ENSMUST00000179234 2050 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Muc19-202ENSMUST00000160242 9104 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 D7Ertd443e-201ENSMUST00000094002 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Rars2-201ENSMUST00000029968 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Harbi1-205ENSMUST00000142692 3686 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Hoxd9P28357 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm15574-201ENSMUST00000119937 405 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm12455-201ENSMUST00000121242 416 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm13218-201ENSMUST00000128180 265 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Fam229b-206ENSMUST00000136546 592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Hoxd9P28357 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Hoxd9P28357 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Hoxd9P28357 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Lcn11-201ENSMUST00000091278 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gpbp1-202ENSMUST00000091236 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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