Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prrt4B2RU40 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms