Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms