Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms