Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms