Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms