Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms