Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rlbp1Q9Z275 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rlbp1Q9Z275 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms