Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx39bQ9Z1N5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx39bQ9Z1N5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms